Der har specielt i sydfynske medier været kørt en al for ensidig kampagne mod Søby Værft i forbindelse med sagen om Faaborg III, mener værftsdirektør Roar Falkenberg.
Færgen har siden sin idriftsættelse sidste sommer været ramt af en række tilfælde af tekniske problemer m.v., der bl.a. har forårsaget en stribe aflysninger – der så igen har sat gang i det pågældende efter hans mening skæve mediefokus.